Основна идеја дизајна МББР-а је да буде у стању да ради непрекидно, без зачепљења, без повратног испирања, са малим губитком главе и великом специфичном површином. Ово се може постићи тако што биофилм расте на мањим носећим јединицама, које се слободно крећу са протоком воде у реактору. У аеробним реакторима, носач се помера аерацијом, а у аноксичним/анаеробним реакторима, носач се помера механичким мешањем. Да би се спречио губитак материјала за паковање у реактору, на излазу из реактора може се поставити порозни филтер (слика 1). МББР су углавном правоугаоног или цилиндричног облика. Правоугаони реактор је равномерно подељен на неколико или ниједан одељак са преградама по дужини резервоара. Уопштено говорећи, ток воде је у стању потисног протока у реактору, док се у свакој ћелији ток воде потпуно меша због флуидизације аерације. Резервоар је напуњен полиетиленским или полипропиленским суспензијским паковањем са специфичном тежином близу воде и великом специфичном површином, а површина за причвршћивање биофилма у реактору може да достигне 500 м2/м3, а стварна специфична површина (унутрашња површина пунило) износи 350 м2/м3. Перфорирана цев за аерацију је аерирана са једне стране да би паковање циркулисало кроз резервоар. Дно цилиндричног реактора је опремљено микропорозном главом за аерацију. Поред тога, неки реактори нису опремљени само уређајем за аерацију на дну резервоара, већ и уређајем за мешање. Ови уређаји за мешање омогућавају да се реактор лако и флексибилно користи у аноксичним условима. Понекад да би се спречило уклањање ваздуха и испаравање изазвано аерацијом, изнад реактора се може додати поклопац.
У страним земљама, МББР је коришћен за извођење малих, пилот-размера и продуктивних студија о третману кућне канализације и неких индустријских отпадних вода и постигнути су добри резултати. Резултати испитивања показују да је процес третмана отпадних вода са покретним слојем биофилма погодан за третман средње и мале кућне канализације и индустријске органске отпадне воде. Међу њима, интегрисани или закопани уређаји за пречишћавање отпадних вода имају добру перспективу за промоцију и примену у Кини. Међутим, још увек постоје неки проблеми са реакторима са покретним слојем биофилма, као што су неравномерно кретање материјала за паковање у реактору и различити степен мртвих зона у резервоару. Како побољшати карактеристике хидрауличког протока у реактору и смањити радну потрошњу енергије је проблем вредан детаљне расправе у развоју реактора са покретним слојем биофилма. Рад МББР на исти начин као и СБР је побољшање МББР технологије, која се зове Мовинг.Бед Секуенцинг БатцхБиофилм Реацтор (МБСББР), која има предности и МББР и СБР. Још једно побољшање је да се материјал за паковање циркулише са протоком воде у реактору, који се назива реактор за биофилм са цикличним мобилним носачем, који има предности и МББР и реактора са интерном циркулацијом.